隨著中國海軍遼寧號與山東號航艦逐步形成戰鬥群打擊戰力，軍機與軍艦繞台進行跨區訓練走向常態化，過去藉由中央山脈為屏障的花蓮佳山基地，將失去天然保護，如何因應解放軍由東部海域發動的正面攻擊的防衛，已經是國軍近年來在漢光兵推上另個演練項目，但佳山基地保障內部人員安全的核生化過濾系統更新案卻以商規來執行，甚至忽略了抗EMP電磁脈衝功能，軍方有必要重新評估來彌補這個缺口。

解放軍進行遠海長航繞台　我軍調整外部防衛戰力部屬

中國解放軍從2016年底起不定期實施軍機或軍艦「遠海長航」繞台的跨區訓練，國防部從2018年開始將原本部署在西部的「愛國者」與天弓防空飛彈陸續移防東部來擔負空防任務。同時也針對花蓮佳山基地與台東志航基地，面對解放軍航艦戰鬥群與巡弋飛彈由東部海域直接正面攻擊，開始調整外部防衛戰力的部署。

例如以「天武七號」將天兵雷達與35快砲性能提升後，加上地對空型麻雀飛彈的快砲、飛彈的低空區域防衛系統，布署在佳山基地附近的高地上，經多次電腦兵推計算，已可有效防禦巡弋飛彈與攻陸飛彈的攻擊；另外，加入耗彈量大的陸基型方陣快砲系統，也是在思考建構的方向之一。

核生化系統設計採美規　更新案改「商規」忽略安全性

由於花蓮佳山基地內具備指揮管制、通信及監偵系統、與彈藥庫、油料庫及小型醫院等戰備設施。主體工程在山脈內有防震抗炸功能外，洞庫前重達8噸的鐵門也具有此功能，就因為該基地具備指揮管制、通信中心，才設有核生化過濾系統，來保障基地內部不因核生化攻擊而癱瘓，因此當年設計的核生化系統完全採用美軍規的標準來建構，但後續更新案卻是以商規來執行，這忽略了當初設計的安全性。

知情人士指出，軍規與商規無論是檢測作業環境溫度，或是過濾器內針對毒氣微粒的濾芯，以及面對核子攻擊所產生的電磁脈衝的防護，軍規遠比商規要嚴格，尤其抗EMP電磁脈衝功能，其防護設備是從對外各個通風、通氣口以及通信天線、電力等各項電纜線路，以及內部設備都要以良好的接地、屏蔽和濾波，來抗輻射與電磁脈衝，只要其中一環忽略，電磁脈衝能量透過電線或是通信天線的傳導，或是從通氣的縫、孔、窗進入內部，破壞系統中電子元器件、集成電路、電路板等，達到破壞癱瘓整個系統無法工作。因而軍方有必要重新檢視以商規來更換核生化系統，是否能真正達到防護佳山基地的內部安全。